处理税后扣款通常涉及以下步骤：确定账单日确定发薪的日期，确保薪水按月度定期发放。计算所得税根据员工的工资总额、所得限额及抵扣额来计算所得税。考虑专项附加扣除，如住房租金、住房贷款利息等。确定扣除项目确定需要缴纳的所得税，以及专项附加扣除项目。根据月度缴纳大额医疗保险金扣除，根据具体税率及报表要求计算